Groupe de travail
Homologie persistante
et biologie moléculaire
Le vendredi ou jeudi à 12h30 sur zoom
Inscription : contacter Philippe Malbos
Printemps 2024
Programme prévisionnel :
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28/03 - Prédiction des températures optimales de croissance des Methanococcales par homologie persistance des structures 3D de protéines (II).
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21/03 - Prédiction des températures optimales de croissance des Methanococcales par homologie persistance des structures 3D de protéines (I).
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14/03 - Analyse d’images radiographiques thoraciques par homologie persistante pour la prédiction histologique du cancer du poumon.
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07/03 - Simulations d'évolution de protéines par persistance topologique.
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23/02 - Analyse du signal phylogénétique contenu dans les structures 3D de protéines.
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16/02 - Principes et méthodes de l’homologie persistante (exemples d'applications : résolutions de protéines et images de scanner) (II).
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09/02 - Principes et méthodes de l’homologie persistante (exemples d'applications : résolutions de protéines et images de scanner) (I).
Methanococcus jannaschii grown at 78C and 30 psi.
Cultivated by Chan B. Park, Dept. Chem. Eng., UC Berkeley.
Printemps 2023
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07/07 - Retour sur la thermoadaptation (II), CBA.
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30/06 - Retour sur la thermoadaptation (I), CBA.
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23/06 - L'homologie persistante révèle le signal phylogénétique contenu dans les structures 3D des protéines, LBD-CBA-PhM.
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09/06 - Persistance et courbure (II), JNG-LBD.
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02/06 - Persistance et courbure (I), JNG-LBD.
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26/05 - Prédiction de structures 3D de protéines avec AlphaFold (III et fin), JNG-LBD.
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12/05 - Prédiction de structures 3D de protéines avec AlphaFold (II), JNG-LBD.
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28/04 - Modèles d'évolution des séquences de protéines (III et fin), CBA,
- Prédiction de structures 3D de protéines avec AlphaFold, JNG-LBD.
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21/04 - Modèles d'évolution des séquences de protéines (II), CBA.
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07/04 - Modèles d'évolution des séquences de protéines, CBA.
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03/03 - Géométrie de la structure tertiaire des protéines, LBD.
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17/03 - Homologie persistante des structures 3D des protéines : état de l'art et perspectives, LBD.
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10/03 - Signal phylogénétique dans les structures 3D des protéines par homologie persistante, LBD-CBA-PhM.
Printemps 2022
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24/06 - Espaces métriques dynamiques et persistance, Joseph Nardin-Gennequin.
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17/06 - Correlation entre distances phylogénétiques et topologiques, Léa Bou Dagher.
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10/06 - Homologie persistante : point de vue catégorique, Léo Brochier.
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03/06 - Théorie de la persistance multidimensionnelle (II), Joseph Nardin-Gennequin.
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27/05 - Relâche.
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20/05 - Théorie de la persistance multidimensionnelle (I), Joseph Nardin-Gennequin.
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13/05 - Reconstruction phylogénétique via les paysages de persistance, LBD-CBA-PhM.
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06/05 - Faisceaux sur les complexes simpliciaux et persistance, Joseph Nardin-Gennequin.
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15/04 et 22/04 - Relâche.
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08/04 - Modules de persistance et calcul effectif de la persistance (III), Philippe Malbos.
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01/04 - Modules de persistance et calcul effectif de la persistance (II), Philippe Malbos.
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18/03 - Modules de persistance et calcul effectif de la persistance (I), Philippe Malbos.
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11/03 - Théorie de Morse discrète : homologie de Morse, Fida El Chami.
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04/03 - Thermoadaptation des organsimes et paysages de persistance (III), LBD-CBA-PhM.
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18/02 - Thermoadaptation des organsimes et paysages de persistance (II), LBD-CBA-PhM.
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11/02 - Thermoadaptation des organsimes et paysages de persistance (I), LBD-CBA-PhM.
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28/01 - Quelques concepts algébriques, Léa Bou Dagher.
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21/01 - Complexes et modules de persistance (II), Léa Bou Dagher.
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14/01 - Complexes et modules de persistance (I), Léa Bou Dagher.
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07/01 - Séance d'organisation.
Automne 2021
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17/12 - Introduction à la théorie de Morse discrète, Fida El Chami (Lebanese University).
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10/12 - Étude de la thermoadaptation par persistance topologique (III), Céline Brochier-Armanet.
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03/12 - Étude de la thermoadaptation par persistance topologique (II), Céline Brochier-Armanet.
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26/11 - Les paysages de persistance, Léa Bou Dagher.
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12/11 - Étude de la thermoadaptation par persistance topologique (I), Céline Brochier-Armanet.
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29/09 - La filtration de Vietoris-Rips, Léa Bou Dagher.
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22/10 - La persistance topologique (II), Philippe Malbos.
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15/10 - La persistance topologique (I), Philippe Malbos (ICJ).
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01/10 - Les briques du vivants et la vie dans les milieux extrêmes (II), Céline Brochier-Armanet.
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24/09 - Introduction à l'homologie simpliciale, Léa Bou Dagher (ICJ).
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17/09 - Les briques du vivants et la vie dans les milieux extrêmes (I), Céline Brochier-Armanet (LBBE).
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10/09 - L'idée primitive de la topologie algébrique, Kenji Iohara (ICJ).
