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Charlotte Dugourd-Camus

Doctorante en mathématiques appliquées

Présentation

Depuis octobre 2022, je poursuis mes études en doctorat de mathématiques au sein de l'équipe Inria MUSICS (anciennement Dracula). Je suis membre de l'Institut Camille Jordan et étudiante à l'Université Claude Bernard Lyon 1. Sous la direction de Mostafa Adimy, je travaille sur la modélisation des maladies infectieuses.

Formation :
Doctorat, Mathématiques appliquées - Inria, Université Claude Bernard Lyon 1, Institut Camille Jordan, 2022-2025
Master 2 de recherche, Mathématiques pour la biologie et la médecine - Université Claude Bernard Lyon 1, 2021-2022
Epidémiologie, Dynamique des populations, Optimisation et machine learning, Modélisation statistique, Introduction à la statistique en grande dimension, Introduction aux processus stochastiques.
Master 1 de Mathématiques appliquées, Statistique - Université Claude Bernard Lyon 1, 2020-2021
Systèmes dynamiques, Analyse appliquée et EDP, Statistique paramétrique, Schémas numériques, Probabilité, Séries temporelles.

Domaine de Recherche

Ma recherche porte sur la modélisation des maladies infectieuses d'un point de vue immunologique et épidémiologique. L'objectif de ma thèse est de proposer un modèle multi-échelle, i.e. un modèle épidémiologique dépendant de l'échelle immunologique.

Titre de ma thèse : Modélisation immuno-épidémiologique de la dynamique des infections intra- et inter-hôtes : application à la dengue hémorragique

Axes :

  • Modélisation immunologique: modèle inter-hôte, ODEs, nombre de reproduction immunologique de base, stabilité locale et globale, algorithme génétique
  • Analyse statistique: analyse de données, modèle inter-hôte structuré par âge, algorithme MCMC, maximisation de la vraisemblance
  • Modélisation immuno-épidémiologique : modèle emboîté, modèle structuré par âge, maladie multi-sérotypes, réinfection, nombre de reproduction de base, nombre de reproduction d'invasion, bifurcation 'backward'
  • Modélisation des stratégies de contrôle : modèles épidémiologiques SIR - SIS, système hybride, vaccination, isolement, persistance, fonctionnelle de Lyapunov
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Publications

  • M Adimy, A Chekrounb, C Dugourd-Camus. Is it more effective to protect susceptible individuals or isolate infected people to prevent the spread of a SIR-type epidemic? - Discrete and Continuous Dynamical Systems - B, 30(7), 2429-2459, (2025). DOI : 10.3934/dcdsb.2024172 (HAL).
  • C Dugourd-Camus, C P. Ferreira, and M Adimy. Modeling the mechanisms of antibody mixturesin viral infections: the cases of sequential homologous and heterologous dengue infections - Journal of the Royal Society Interface, 21(219), (2024). DOI : 10.1098/rsif.2024.0182 (HAL).
  • M Adimy, A Chekroun, C Dugourd-Camus, and H Meghelli. Global asymptotic stability of a hybrid differential–difference system describing sir and sis epidemic models with a protection phase and a nonlinear force of infection - Qualitative Theory of Dynamical Systems, 23 (34), (2024). DOI : 10.1007/s12346-023-00891-z (HAL).
  • C Dugourd, A Abichou-Klich, R Ecochard, and F Subtil. Clustering of trajectories with mixed effects classification model: Inference taking into account classification uncertainties - Statistics in Medicine, 42(25), (2023). DOI :10.1002/sim.9876.

Soumisions

  • M Adimy, C Dugourd-Camus, R Taieb. Multi-serotype nested immuno-epidemiological model for dengue hemorrhagic fever involving backward bifurcation and serotype invasion 2025

Projets en Cours

  • Analyse statistique des données de surveillance et de séroprévalence de la dengue à Mayotte - Avec le CNRS, l'ARS Mayotte et Santé publique France, nous travaillons sur les données de la dengue à Mayotte, fournissant notamment des informations sur les sérotypes. Notre cherchons à comprendre et interpréter, grâce à un modèle mathématique, les données disponibles. En particulier, nous nous intéressons à la force d'infection pour chaque période de temps et à la probabilité de détection. Nous souhaitons évaluer l'efficacité du système de surveillance mis en place à Mayotte, fournir le profil immunitaire de la population et anticiper l'impact de futures épidémies.
    Reconstructing the history of Dengue circulating in Mayotte (2014-2021).

Enseignements

  • TD d'Algèbre 1 - Licence 1, Université Claude Bernard Lyon 1 - 2023
  • TD d'Algèbre 2 - Licence 1, Université Claude Bernard Lyon 1 - 2023- 2025
  • TD d'Algèbre 3 - Licence 2, Université Claude Bernard Lyon 1 - 2024
  • TD d'Algèbre 4 - Licence 2, Université Claude Bernard Lyon 1 - 2023
  • Khôles d'Algèbre et d'Analyse - Première année d'école Polytech Lyon - 2023-2024

Contact

Email: charlotte.dugourd@inria.fr

ORCID: 0009-0003-6870-9964

Adresse: Inria - Bâtiment CEI2 - 56 Boulevard Niels Bohr, 69100 Villeurbanne, France

Téléphone: 04 72 43 75 22

Presentation

Since October 2022, I have been studying for a PhD in mathematics in the Inria MUSICS team (formerly Dracula). Under the supervision of Mostafa Adimy, I'm working on the modeling of infectious diseases.

Education:
PhD, Applied Mathematics - Inria, Université Claude Bernard Lyon 1, Institut Camille Jordan. 2022-2025
Master 2 - Applied Mathematics for Biology and Medicine - Université Claude Bernard Lyon 1, 2021-2022
Epidemiology, Population dynamics, Optimization and machine learning, Statistical modeling, Introduction to high-dimensional statistics, Introduction to stochastic processes.
Master 1 - Applied Mathematics, Statistics - Université Claude Bernard Lyon 1, 2020-2021
Dynamical systems, Applied analysis and PDE, Parametric statistics, Numerical schemes, Probability, Time series.

Research Areas

My research focuses on the modeling of infectious diseases from an immunological and epidemiological perspective. The aim of my thesis is to propose a multi-scale model, i.e. an epidemiological model dependent on the immunological scale.

Thesis title: Nested immuno-epidemiological modeling of the dynamics of intra- and inter-host infections: application to Dengue Hemorrhagic Fever

Mathematical axes :

  • Immunological modeling: inter-host model, ODEs,immunological basic reproduction number, local and global stability, genetic algoritm
  • Statistical analysis: data analysis, age-structured between-host model, MCMC algorithm, likelihood maxmization
  • Immuno-epidemiological modeling: nested model, multi-serotype disease, reinfection, age-structured model, basic reproduction number, invasion reproduction number, backward bifurcation
  • Control strategies modeling: SIR - SIS epidemiological models, hybrid system, vaccination, isolation, persistence, Lyapunov functional
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Publications

  • M Adimy, A Chekrounb, C Dugourd-Camus. Is it more effective to protect susceptible individuals or isolate infected people to prevent the spread of a SIR-type epidemic? - Discrete and Continuous Dynamical Systems - B, 30(7), 2429-2459, (2025). DOI : 10.3934/dcdsb.2024172 (HAL).
  • C Dugourd-Camus, C P. Ferreira, and M Adimy. Modeling the mechanisms of antibody mixturesin viral infections: the cases of sequential homologous and heterologous dengue infections - Journal of the Royal Society Interface, 21(219), (2024). DOI : 10.1098/rsif.2024.0182 (HAL).
  • M Adimy, A Chekroun, C Dugourd-Camus, and H Meghelli. Global asymptotic stability of a hybrid differential–difference system describing sir and sis epidemic models with a protection phase and a nonlinear force of infection - Qualitative Theory of Dynamical Systems, 23 (34), (2024). DOI : 10.1007/s12346-023-00891-z (HAL).
  • C Dugourd, A Abichou-Klich, R Ecochard, and F Subtil. Clustering of trajectories with mixed effects classification model: Inference taking into account classification uncertainties - Statistics in Medicine, 42(25), (2023). DOI :10.1002/sim.9876.

Submitted papers

  • M Adimy, C Dugourd-Camus, R Taieb. Multi-serotype nested immuno-epidemiological model for dengue hemorrhagic fever involving backward bifurcation and serotype invasion (2025)

Ongoing Projects

  • Statistical analysis of dengue surveillance and seroprevalence data in Mayotte - With CNRS, ARS Mayotte and Santé publique France, we are working on dengue data for Mayotte, providing information on serotypes in particular. Our aim is to use a mathematical model to understand and interpret the available data. In particular, we are interested in the strength of infection for each time period and the probability of detection. We aim to assess the effectiveness of the surveillance system set up in Mayotte, provide the immune profile of the population and anticipate the impact of future epidemics.
    Reconstructing the history of Dengue circulating in Mayotte (2014-2021).

Teaching

  • Tutorials Algebra 1 - Licence 1, Université Claude Bernard Lyon 1 - 2023
  • Tutorials Algebra 2 - Licence 1, Université Claude Bernard Lyon 1 - 2023- 2025
  • Tutorials Algebra 3 - Licence 2, Université Claude Bernard Lyon 1 - 2024
  • Tutorials Algebra 4 - Licence 2, Université Claude Bernard Lyon 1 - 2023
  • Oral exams Algebra and Analysis - Fisrt year of Polytech Lyon - 2023-2024

Contact

Email: charlotte.dugourd@inria.fr

ORCID: 0009-0003-6870-9964

Address: Inria - Bâtiment CEI2 - 56 Boulevard Niels Bohr, 69100 Villeurbanne, France

Phone: 04 72 43 75 22

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