Rémi Monasson

De l'ouverture de l'ADN à sa séquence : quelques problèmes inverses de marche aléatoire en milieu aléatoire

 



1. Introduction : - les expériences de micromanipulation - dégraffage de l'ADN/ARN à force fixée et à extension fixée - modélisation de l'ouverture à séquence fixée : lien avec les marches aléatoires en milieu aléatoire

2. Inférence "dynamique" : - notions d'inférence bayesienne, information de Chernoff - application au modèle de Sinai discret - application au dégraffage de l'ADN : algorithme de Viterbi

3. Vers une inférence réaliste : - Limitations physiques : échelles de temps des processus en cours, élasticité des brins dégraffés, simulations "réalistes" - inférence à l'équilibre thermodynamique : entropie des séquences possibles en fonction de la précision des mesures - perspectives expérimentales et théoriques




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